খাদ্য পরিপাকে HCl এসিড গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। HCl এসিড খাদ্যের মধ্যে কোনো অনিষ্টকারী ব্যাকটেরিয়া থাকলে তা মেরে ফেলে। ইহা নিষ্ক্রিয় পেসিনোজেনকে সক্রিয় পেপসিনে পরিণত করে এবং পাকস্থলিতে পেপসিনের সুষ্ঠ কাজের জন্য অম্লীয় পরিবেশ সৃষ্টি করে পরিপাকে সহায়তা করে।