বাষ্পপাতন পদ্ধতিতে পানিতে অদ্রবণীয় জৈব নমুনাকে বাষ্প প্রবাহে বাষ্পীভূত করে অনুদ্বায়ী অপদ্রব্যের মিশ্রণ হতে পাতন করে পৃথক করা হয়। বাষ্প পাতন পদ্ধতিতে উচ্চ স্থির স্ফুটনাঙ্ক বিশিষ্ট যৌগ ব্যবহৃত হয় (যেমন: বেনজিন, ফেনল) যা কম তাপমাত্রায় পাতিত হয়। পরস্পর মিশে না এমন দুটি তরল (যেমন: পানি ও বেনজিন) এমনভাবে উত্তপ্ত করা হয় যেন মিশ্র তরলের আংশিক চাপের যোগফল বায়ুমণ্ডলীয় চাপের সমান হয়। ফলে মিশ্রণ তাদের উপাদানের স্ফুটনাঙ্ক অপেক্ষা কম তাপমাত্রায় ফোটে।