অনেকগুলি কারণে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে, যেমন-
(1) উত্তরপ্রদেশ থেকে বিহার হয়ে পশ্চিমবঙ্গ পর্যন্ত গঙ্গার তীরে বহু প্রথম শ্রেণির শহর আছে। (প্রথম শ্রেণির শহর বলতে সেই শহরগুলিকে বোঝায়, যার জনসংখ্যা এক লক্ষের বেশি।) এই শহরগুলি থেকে নর্দমার জল, মলমূত্র, দৈনন্দিন আবর্জনা, সাবান জল, সমস্ত গঙ্গা নদীতে পড়ছে। বৈজ্ঞানিকদের হিসেবমতো এর গড় পরিমাণ হল প্রতিদিন 120 কোটি লিটার। ফলে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে। গঙ্গার 70 ভাগ দূষণের জন্য এই ছোটো-বড়ো শহরগুলি দায়ী।
(2) গঙ্গার তীরে প্রচুর কলকারখানা রয়েছে। যেমন, চর্ম শিল্প, কার্পাস বয়ন শিল্প, রাসায়নিক শিল্প, পাট শিল্প, তাপবিদ্যুৎ উৎপাদন শিল্প, ইঞ্জিনিয়ারিং শিল্প ইত্যাদি। এদের বর্জ্য পদার্থ, গরম জল, বিষাক্ত রাসায়নিক মিশ্রিত জল সব গঙ্গায় পড়ছে। ফলে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে। গঙ্গার 20 ভাগ দূষণের জন্য এই কলকারখানাগুলি দায়ী।
(3) কৃষি গঙ্গার অববাহিকার মানুষের প্রধান উপজীবিকা। বেশি ফসল উৎপাদন করার জন্য কৃষকরা তাদের জমিতে রাসায়নিক সার ও কীটনাশক ওষুধ দিচ্ছে। ফলে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে। গঙ্গার আট ভাগ দূষণের জন্য এই কৃষিজাত আবর্জনাগুলি দায়ী।
(4) গঙ্গা নদীর দুপাশে অবস্থিত গ্রামগুলির গোরু-মহিষ স্নান করানো, গঙ্গার পাশে মলমূত্র ত্যাগ করা, গঙ্গার জলে কাপড় কাচা প্রভৃতি কাজের ফলে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে।
(5) প্রতি বছর বন্যায় গবাদি পশুর মৃতদেহ, মানুষের মৃতদেহ এবং অন্যান্য আবর্জনা গঙ্গায় এসে মিশছে। এ সবের ফলে সামগ্রিকভাবে গঙ্গার জল ক্রমশ দূষিত হচ্ছে।
(6) ভারতের নদীগুলির মধ্যে গঙ্গা ভারতীয়দের কাছে অন্যতম পবিত্র নদী। তাই গঙ্গাতীরে মৃতদেহ দাহ করা হয়। দেবদেবীর প্রতিমা গঙ্গায় বিসর্জন দেওয়া হয়। পূজার ফুলপাতা গঙ্গাজলে ফেলা হয়। এ সবই লক্ষ লক্ষ ভারতীয় প্রতিদিন প্রতিনিয়ত 2525 কিলোমিটার লম্বা গঙ্গানদীতে কোথাও না কোথাও কয়েকশো বছর ধরে করে চলেছে। ফলে গঙ্গার জল দূষিত হচ্ছে।